Ve středu 15. července v 15 hodin odpoledne byly kompletně zprovozněny odjezdy vlaků jednotlivých linek z Masarykova nádraží. Nádraží zůstalo 16 hodin uzavřené a příčina vykolejení vlaku se bude vyšetřovat. Existuje možnost technické závady, ale také lidské chyby. Škoda byla vyčíslena na 4,2 milionu korun.
Vlaky S1 do Českého Brodu byly odkloněny na železniční zastávku Praha-Holešovice. Na lince S2 (Kolín, Nymburk) a S34 (Praha - Čakovice) začínaly a končily vlakové soupravy v Praze - Vysočanech. Z holešovického nádraží vyjížděly vlaky R4 a S4 směrem do Ústí nad Labem přes Kralupy nad Vltavou. Vlaky do Kladna a Rakovníka (S5, R5) začaly jezdit od 10 hodin bez omezení.